Чешкият център в София е успешен партньор на EUNIC България, Международния филмов фестивал „София Филм Фест“, Cinelibri, фестивалa на документалното кино „София ДокуМентал“, „Срещи на младото европейско кино“, Кино под звездите – Бургас, театралните фестивали „Варненско лято“ и „Световен театър в София“, Международния фестивал за уличен и куклен театър „Панаир на куклите“, Европейския музикален фестивал, Международния литературен фестивал, Международния фестивал на поезията „Орфей“ - Пловдив, литературния фестивал „Пловдив чете“, Международния фестивал за дизайн „Мелба“, Международното биенале на стъклото, Националната галерия, Националната художествена академия и много други.
Той си сътрудничи с чуждестранни културни институти, Столична община, с други български общини, библиотеки и галерии в Пловдив, Варна, Велико Търново, Русе, Габрово, Нова Загора, Стара Загора, Перник, Шумен, Хасково, Кюстендил, Балчик, Сливен, и много други, както и с университетите с преподаване на чешки език в София и Пловдив.
С издателствата „Колибри“, „Труд“, „Ерго“, „Персей“, „Изида“, Black Flamingo Publishing, „Жанет 45“, „Парадокс“, СОНМ и др., с Чехословашкия клуб „Т. Г. Масарик“ в България, „Бохемия клуб“, с дружествата за приятелство и т.н.